L'équipe du Parc compte une quinzaine d’agents permanents et des agents sur contrats courts liés à des projets spécifiques.
Elle est organisée autour de deux services: le service « ingénierie » et le service « opérations ».

-    Le service « Ingénierie » est chargé de mettre en place les mesures de gestion prévues dans le plan de gestion, de préparer les dossiers relatifs aux avis des conseils de gestion, de préparer et de réaliser les plans d’action annuels. Il conduit ces actions en liaison étroite avec le service « Opérations ».

-    Le service « Opérations » a en charge la surveillance et le contrôle des usages, les suivis scientifiques et la relation avec les usagers. La plupart des agents sont commissionnés et assermentés.

À ces deux services s’ajoutent des fonctions supports - communication, secrétariat, géomatique et gestion des données marines – directement rattachées au directeur délégué.

Le directeur du Parc, Frédéric Fasquel, est délégué du directeur général de l’OFB auprès du conseil de gestion.

L’équipe du Parc fait partie de la direction régionale des Hauts de France de l’OFB dirigée par Patrick Bertrand.