La conservation de la biodiversité et le maintien de la productivité des écosystèmes dépendent étroitement des conditions générales de la colonne d’eau et les sédiments. En effet, il est nécessaire que différents paramètres physico-chimiques, tels que l’oxygène, la turbidité, les nutriments, se situent dans des gammes de concentration en accord avec l’équilibre des réseaux trophiques, et conditionnent en particulier le bon développement des premiers maillons de ces réseaux.