Les hauts de plages et les dunes du Parc naturel marin abritent trois espèces rares et menacées : le Gravelot à collier interrompu, le Petit gravelot et le Grand gravelot.
Un inventaire des oiseaux fréquentant l’estuaire de la Slack a été réalisé en 2020 par le Groupe ornithologique et naturaliste du Nord – Pas-de-Calais et financé par le Parc naturel marin.
Les Phoques gris sont présents dans les eaux du Parc : en 2017, 400 d’entre-eux ont été observés simultanément de la frontière belge à la baie de Somme.
Le Parc et l'observatoire PELAGIS mènent une étude sur la mégafaune marine - oiseaux, mammifères et éventuelles autres espèces de grande taille - par observation aérienne.
Les oiseaux en mer sont divisés en deux catégories : les oiseaux marins du large et les oiseaux marins côtiers. Nombreux à survoler le littoral et les eaux du Parc, ils sont pour la plupart des espèces à enjeux de préservation.
Les vasières et les plages de sable et de galets du Parc abritent plusieurs mois dans l’année le Gravelot à collier interrompu, une espèce rare et menacée.