Le littoral du Parc naturel marin, et en particulier les estuaires picards de la Slack, de la Canche, de l'Authie et de la Somme, accueille de nombreuses espèces de limicoles côtiers et d'anatidés (canards et oies), ces oiseaux qui vivent et se nourrissent sur les zones humides en bord de plage et les marais.
Les oiseaux en mer sont divisés en deux catégories : les oiseaux marins du large et les oiseaux marins côtiers. Nombreux à survoler le littoral et les eaux du Parc, ils sont pour la plupart des espèces à enjeux de préservation.
Les vasières et les plages de sable et de galets du Parc abritent plusieurs mois dans l’année le Gravelot à collier interrompu, une espèce rare et menacée.
Les hauts de plages et les dunes du Parc naturel marin abritent trois espèces rares et menacées : le Gravelot à collier interrompu, le Petit gravelot et le Grand gravelot.
Le Phragmite aquatique est un passereau (oiseau de petite taille) menacé. Les estuaires du Parc possèdent vraisemblablement une importance internationale pour la conservation de l’espèce.
Le Parc et l'observatoire PELAGIS mènent une étude sur la mégafaune marine - oiseaux, mammifères et éventuelles autres espèces de grande taille - par observation aérienne.
Un protocole de suivi a été développé pour caractériser et localiser les zones d'alimentation des limicoles côtiers et les activités humaines sur l'estran. Le Parc naturel marin y contribue en le mettant en place dans ses estuaires.
De nombreuses espèces d'oiseaux fréquentent le Parc naturel marin des estuaires picards et de la mer d'Opale, tant sur le littoral que plus au large. Améliorer la connaissance de ces espèces est un objectif du Parc.
Un inventaire des oiseaux fréquentant l’estuaire de la Slack a été réalisé en 2020 par le Groupe ornithologique et naturaliste du Nord – Pas-de-Calais et financé par le Parc naturel marin.